Ochrana

V Červenom zozname IUCN je Netopier veľký zaradený medzi menej dotknuté taxóny. Podľa Červeného zoznamu cicavcov na Slovensku patrí do kategórie menej ohrozených taxónov a podkategórie taxónov závislých od ochrany. Netopier veľký bol zaradený väčšinou medzinárodných dohovorov medzi chránené druhy s potrebou ochrany ich biotopov, vrátane Dohody o ochrane populácií európskych netopierov. Podľa smernice o biotopoch, patrí medzi druhy živočíchov európskeho významu, ktoré si vyžadujú prísnu ochranu a ochrana ktorých si vyžaduje vyhlásenie osobitných chránených území. Podľa vyhlášky Ministerstva životného prostredia Slovenskej republiky č. 24/2003 je na Slovensku druhom európskeho významu, na ochranu ktorého sa vyhlasujú chránené územia a je chráneným druhom európskeho významu. Spoločenská hodnota za jedného jedinca je 331,93 €.